样本准备：首先，需要提取DNA样本，并进行必要的处理，如PCR扩增，以便获得足够数量的DNA片段进行分析。
测序反应：在测序反应中，使用特定的荧光标记的ddNTP（二脱氧核糖核苷酸三磷酸）作为合成DNA链的原料。这些标记的ddNTP会在DNA聚合酶的作用下被整合到新合成的DNA链上，每插入一个标记的ddNTP，就会发出特定颜色的荧光信号。
毛细管电泳：将带有荧光标记的DNA片段放入毛细管中，通过施加电压，使DNA片段在毛细管中移动。由于不同长度的DNA片段在电场中的迁移速率不同，它们会按照长度顺序分离。
荧光检测：在毛细管的特定位置设有激光检测器，它能够检测通过的荧光信号。每次插入一个标记的ddNTP，都会产生一个荧光信号，这些信号被激光检测器捕捉并记录下来。
数据分析：计算机软件接收来自激光检测器的信号，并将其转换为DNA序列。软件会根据荧光信号的颜色和强度来确定插入的ddNTP类型，进而推断出DNA序列。
结果输出：最后，软件将解析出的DNA序列以图形或文本的形式输出，供科学家进一步分析。
这个过程可以用来进行DNA测序、基因分型、突变检测等多种分子生物学研究。不同型号的基因分析仪可能在具体的技术细节上有所不同，但基本原理大致相同。